Nazwisko Pajączkowski jest formą pochodną od pajączek – zdrobnienia rzeczownika pająk. Mianem pajączka określano także wzór na pisankach, zob. tzw. Słownik warszawski języka polskiego, t. IV, s. 10. Rzeczownik pajączek stał się także podstawą nazwy miejscowej Pajączków, która należała do szlacheckiego rodu Pajączkowskich vek. Pajanczkowskich, Jan Siwik, Encyklopedia nazwisk i przydomków szlacheckich, Warszawa 2010, s. 536.
